Напередодні 50-річчя Жовтневої революції, 14 травня 1966 року, у Зміївській середній загальноосвітній школі № 1 було створено Музей Бойової слави (наказ Міністерства освіти УРСР № 39).
27 серпня 1996 року Музей було перереєстровано як історико-краєзнавчий музей Зміївської загальноосвітньої середньої школи № 1 (реєстраційний № 498). Чергова перереєстрація музейної установи відбулася 20 листопада 2001 року.
8 листопада 2011 року, у зв’язку зі 140-річчям навчального закладу (який на цей час вже мав назву Зміївський ліцей № 1 імені двічі Героя Радянського Союзу З. К. Слюсаренка), історико-краєзнавчий музей був реорганізований у музейний комплекс Зміївського ліцею № 1 імені З. К. Слюсаренка і отримав сучасну структуру.